Les tests de laboratoire AR et des ressources
Les tests de laboratoire peuvent aider à guider le traitement du patient, détecter les menaces émergentes et prévenir la propagation de la résistance aux antibiotiques. Le réseau de laboratoires de résistance aux antibiotiques du CDC (AR Lab Network) soutient la capacité de laboratoire
détecter rapidement la résistance aux antibiotiques dans les soins de santé, la nourriture et la communauté, et informer les réponses locales pour prévenir la propagation et protéger les personnes.
Le réseau AR Lab comprend des laboratoires dans 50 États, cinq villes et Porto Rico, y compris sept laboratoires régionaux et le Centre national de surveillance de la tuberculose (National TB Centre).
Types de tests de résistance
Identification des pathogènes
Les laboratoires travaillent pour identifier et confirmer les pathogènes du genre et de l'espèce (germes pouvant causer la maladie) avec résistance. Ce sont souvent les premiers tests effectués par le réseau AR Lab. Ceci est fait par l'une des deux méthodes suivantes:
Tests biochimiques: Classer une espèce particulière par la manière dont elle utilise différents produits chimiques biologiques, comme les protéines ou les sucres.
Spectrométrie de masse: Une technique spécialisée qui recherche l'empreinte d'une protéine pathogène.
Dépistage de la colonisation
Le dépistage de la colonisation est un processus mis en place pour détecter et réduire le risque de propagation de germes dans un établissement de santé (dans ce cas, des germes présentant une résistance inhabituelle). Certaines personnes peuvent porter des germes sans tomber malades ou présenter des symptômes, connus sous le nom de colonisation. Les personnes colonisées peuvent transmettre les germes aux autres sans le savoir. Lorsqu'une résistance inhabituelle est identifiée chez un patient, les agents de santé examinent d'autres patients pour voir s'ils sont colonisés avec le même germe résistant. Cela peut déclencher des actions supplémentaires de contrôle des infections réduisant le risque de propagation et protégeant les patients.
Tests moléculaires
Le test moléculaire est une collection de techniques utilisées pour détecter des gènes spécifiques dans un germe, y compris ceux qui ont et peuvent partager la résistance. Ces tests peuvent être utilisés pour diagnostiquer les infections et guider le traitement des patients.
Test de carbapénémase phénotypique
Un test de carbapénémase phénotypique utilise la culture (un milieu pour cultiver des bactéries) au lieu de la méthode d'essai moléculaire pour déterminer si le pathogène produit une enzyme appelée carbapénémase. Si la carbapénémase est produite, alors un antibiotique de carbapenem est inefficace et ne tuera pas le pathogène.
Test de sensibilité
Test de sensibilité est un type de test de laboratoire qui cultive (cultive) l'agent pathogène afin de montrer la sensibilité d'un germe à différents antibiotiques. Ces tests peuvent être utilisés pour aider à sélectionner le meilleur choix de médicament pour une infection pharmacorésistante, et également fournir des données pour surveiller comment le profil de résistance d'un agent pathogène pourrait changer avec le temps.
Séquençage du génome entier (WGS)
WGS est une procédure de laboratoire qui fournit une empreinte génétique très précise qui peut aider à relier les cas les uns aux autres, permettant ainsi de détecter une éclosion et de la résoudre plus rapidement.
Comment fonctionne le réseau AR Lab
Le réseau AR Lab augmente et soutient la capacité de laboratoire à l'échelle nationale. Cet effort se traduit par une réponse plus rapide pour trouver AR et empêcher sa propagation.
Laboratoires des établissements de soins de santé et laboratoires des services de santé publique
Lorsque les laboratoires des établissements de santé soupçonnent la présence de CRE ou de Pseudomonas aeruginosa (CRPA) résistant au carbapénème, ils envoient les isolats (bactéries isolées d'un échantillon, comme le sang) aux laboratoires du service de santé publique, également appelés laboratoires juridictionnels. Les laboratoires de santé publique confirment l'identité des espèces de la bactérie, et font une susceptibilité supplémentaire et des tests moléculaires pour caractériser (décrire) les isolats de CRE et de CRPA. En plus de la CRE et de l'ACRP, tous les services de santé de l'État peuvent dépister des bactéries entériques (intestinales) comme la bactérie Salmonella. Lorsque les laboratoires de santé publique identifient une résistance inhabituelle, ils avertissent le CDC et peuvent envoyer les isolats à leurs laboratoires régionaux pour des tests supplémentaires si nécessaire.
Laboratoires régionaux et Centre national TB
Les laboratoires régionaux aident à suivre les changements de résistance et à identifier les éclosions. Étant donné que la réponse aux épidémies varie d'un état à l'autre, le soutien peut également varier selon l'état ou la menace découverte. En général, les laboratoires régionaux fournissent un soutien
faire des tests supplémentaires pour caractériser davantage la menace,
fournir un soutien pour répondre à la menace en effectuant des tests de dépistage de la colonisation pour la CRE ou la CRPA, ou une menace fongique émergente comme auris, et
suivi et suivi des découvertes trouvées.
Les laboratoires régionaux coordonnent les efforts locaux et sont situés dans les départements de santé publique suivants:
Maryland,
Minnesota,
New York,
Tennessee,
Texas,
Washington, et
Wisconsin.
Les laboratoires du département de santé publique enverront certains isolats pathogènes, comme la CRE et l'ACRP, aux laboratoires régionaux lorsqu'un soutien est nécessaire, mais le réseau AR Lab reçoit d'autres agents pathogènes de différentes façons. Par exemple, les laboratoires régionaux AR traitent des isolats de N. gonorrhoeae dans le cadre des activités des CDC, notamment deux projets appelés le projet de surveillance des isolats gonococciques (GISP) et le renforcement de la réponse des États-Unis à la gonorrhée résistante (SURRG). Ce travail est un élément clé de la surveillance des tendances de la gonorrhée résistante aux antibiotiques afin de s'assurer que le traitement médicamenteux recommandé pour la gonorrhée fonctionne.
Le Centre national de lutte contre la tuberculose est coordonné par le Département de la santé et des services humains du Michigan et est équipé pour effectuer des WGS pour les isolats de M. tuberculosis aux États-Unis. Le Centre national TB reçoit tous les isolats disponibles des départements de santé publique.